Kun perusteet on sovittu päästään aloittamaan EDI-käyttöönotto. Yleensä toinen kauppakumppani lähettää EDI-operaattorinsa kautta pyynnön aloituksesta joko toiselle kauppakumppanille tai tämän operaattorille -jos kumppanilla on operaattori käytössä.
Käyttöönoton aloituksen yhteydessä pidetään joko etäpalaveri yksityiskohdista tai käydään keskustelu sähköpostitse. Tässä läpikäynnissä on hyvä sopia ainakin seuraavista yksityiskohdista:
Oletuksena kumppani- ja asiakasintegraatio sekä niihin liittyvät sanomien esitystapamuunnokset ja yhdysliikennekäytännöt on jo rakennettu aikaisemmin. Muutoin ne toteutetaan osana EDI-tietoyhteyksien käyttöönottoa, mistä löytyy kuvaus sivustollamme.